Master Page

Para referenciar um controle na master page você precisa procurá-los pelo id dentro do ContentPlaceHolder a que eles pertencem, por exemplo:

ContentPlaceHolder mpContentPlaceHolder = (ContentPlaceHolder)Master.FindControl("IdDoContentPalceHolder");
    if(mpContentPlaceHolder != null)
    {
        Label greetingLabel= 
            (Label) mpContentPlaceHolder.FindControl("GreetingLabel");
        if(GreetingLabel!= null)
        {
            /*Do Stuff*/
        }
    }

Referência: Como: Conteúdo Page Mestre ASP.NET Referência

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